Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFNB1P01574 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms