Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LDLRP01130 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LDLRP01130 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LDLRP01130 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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