Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
DNAL4O96015 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
DNAL4O96015 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
DNAL4O96015 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DNAL4O96015 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms