Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SCN2BO60939 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SCN2BO60939 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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