Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDB2O43679 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms