Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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