Protein–RNA interactions for Protein: O15535

ZSCAN9, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN9O15535 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZSCAN9O15535 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZSCAN9O15535 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms