Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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