Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IQCJ-SCHIP1C9J366 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms