Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms