Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP69A5D8W1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP69A5D8W1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms