Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VWA8A3KMH1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms