Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMX2A2RU54 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms