Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms