Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNFRSF18Q9Y5U5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 697.3 ms