Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNPO3Q9Y5L0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNPO3Q9Y5L0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms