Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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