Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms