Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF3Q9ULT6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms