Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEBQ9UHD4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms