Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPASTQ9UBP0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms