Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VAPAQ9P0L0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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