Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF275Q9NSD4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms