Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB18Q9NP72 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms