Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CEP44Q9C0F1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms