Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VN1R3Q9BXE9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms