Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF7Q9BWX1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF7Q9BWX1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.1 ms