Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms