Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms