Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SEC22CQ9BRL7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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