Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX27Q96L92 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX27Q96L92 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms