Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PGAM5Q96HS1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PGAM5Q96HS1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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