Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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HDAC10Q969S8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDAC10Q969S8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDAC10Q969S8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDAC10Q969S8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDAC10Q969S8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC10Q969S8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC10Q969S8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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