Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms