Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOPBP1Q92547 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOPBP1Q92547 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms