Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM3CQ92520 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms