Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IL1Q8TBN0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms