Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMIEQ8NEW7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms