Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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ZNF248Q8NDW4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ZNF248Q8NDW4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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