Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LINC00612Q8N6U2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms