Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXPE1Q8N323 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms