Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms