Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATG4DQ86TL0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms