Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms