Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRTP1Q5TC63 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms