Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms