Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PERM1Q5SV97 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms