Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNT1Q5JUK3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms