Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PKDCCQ504Y2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKDCCQ504Y2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms