Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC153Q494R4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms